Canal-U

Mon compte

4.3. Quantifier la similarité de deux séquences


Marron Over Mkn0584 Homme Barbour Gn34 Achat Pull 6vwFnnqBS
Copier le code pour partager la vidéo :
<div style="position:relative;padding-bottom:56.25%;padding-top:10px;height:0;overflow:hidden;"><iframe src="https://www.canal-u.tv/video/inria/embed.1/4_3_quantifier_la_similarite_de_deux_sequences.24696?width=100%&amp;height=100%" style="position:absolute;top:0;left:0;width:100%;height: 100%;" width="550" height="306" frameborder="0" allowfullscreen scrolling="no"></iframe></div> Si vous souhaitez partager une séquence, indiquez le début de celle-ci , et copiez le code : h m s Balenciaga Oversized Shell Quilted Red Fr42 Products Jacket xRw1Oq
Auteur(s) :
RECHENMANN Francois
Imperméable Jeans 60 Gj800901 Garcia Femme Manteau Noir UPqnaxHa

Producteur Canal-U :
2018 Ws Green Sur Mid Mtn Trainer Magnetviridian Salewa Gtx 9Inria
Trainer Mid Mtn Sur 2018 Gtx Ws Green Salewa Magnetviridian 9

4.3. Quantifier la similarité de deux séquences

Le principe est donc de rechercher, dans les bases de données, des séquences similaires à celles que nous sommes en train d'étudier. Nous faisons aussi l'hypothèse que plus les séquences sont similaires, meilleure est la pertinence de l'information attachée à la séquence retrouvée dans la base de données.
Nous allons donc chercher un moyen de quantifier le niveau de similarité entre 2 séquences. Le premier moyen très simple, c'est d'utiliser la distance dite de Hamming. De quoi s'agit-il ? Très simple, en effet. Prenez ces 2 séquences ici. Vous pouvez très rapidement à l'oeil voir qu'elles diffèrent par 2 substitutions, 2 différences, ça va être la distance de Hamming. De même, cette paire ici, 3 substitutions, distance de Hamming, 3.
Est-ce une distance véritablement au sens mathématique du terme ? Je vous rappelle les 3 propriétés qu'une distance mathématique doit satisfaire : la distance d'une séquence à elle-même doit être nulle, ce qui est le cas, puisqu'il n'y a pas de différence entre les 2, pas de substitution ni quoi que ce soit, distance 0. La distance entre une séquence et une seconde séquence doit être la même qu'entre la seconde et la première. Bien entendu, le nombre de différences reste le même. Et la 3ème qui est dite l'inégalité qui doit être effectivement vérifiée elle aussi, ce que l'on peut faire assez facilement en prenant quelques exemples. C'est donc bien une distance au sens mathématique...

Femme Parajumper Noir Parajumpers Bomber Gobi France Veste UTqBOq
 
 
RECHENMANN Francois
Femmes Bottes Buffalo 80 Dès Soldes 26 Pour qUSvwUEp

Ingénieur et Docteur-Ingénieur en informatique, François Rechenmann est chercheur au centre Inria Grenoble – Rhône-Alpes. Il y exerce ses activités à l’interface de l’informatique et des sciences du vivant en contribuant plus particulièrement au développement de méthodes et de logiciels pour l’analyse des séquences génomiques des microorganismes. Cofondateur de la société Genostar, qui propose des solutions bioinformatiques aux industries pharmaceutiques, agroalimentaires et biotechnologiques, il en est le conseiller scientifique. Très impliqué dans les actions de médiation scientifique, François Rechenmann est le responsable scientifique du site Interstices dont l’objectif est d’expliquer l’informatique en tant que domaine de recherche.Whiton Femmehomme Bottesboots Hi Biscuit Suede Martens Dr ttPwZp


 
PARMENTELAT Thierry

Thierry Parmentelat a mené une carrière hybride entre les mondes académique et industriel. Ses centres d'intérêt couvrent les langages de programmation, les réseaux, et l'algèbre. Actuellement ingénieur de recherche chez Inria, Thierry Parmentelat utilise Python depuis plus de 10 ans pour ses travaux de recherche, ainsi que pour le développement des plateformes expérimentales dont il a la charge.


Bottines Boots Alastic Lollipops Femme Chelsea OvYZqwq

commentaires


Ajouter un commentaire Lire les commentaires
*Les champs suivis d’un astérisque sont obligatoires.
Aucun commentaire sur cette vidéo pour le moment (les commentaires font l’objet d’une modération)
Green Ws Gtx 9 Mid Trainer Mtn Magnetviridian Salewa 2018 Sur
 

Dans la même collection

Trimmed Suede r1 Adidas Leather Originals Sneakers Micro Metallic fq1nCzvw
 
Tourisme Evo Waterproof Moto Objectif S Et Sportour Sport Tcx xqYB1fv1