Canal-U

Mon compte

4.3. Quantifier la similarité de deux séquences


Chaussures Tbs Ville Brandy De Ville Tbs De Brandy Chaussures Ville Chaussures De ra7qxrv
Copier le code pour partager la vidéo :
<div style="position:relative;padding-bottom:56.25%;padding-top:10px;height:0;overflow:hidden;"><iframe src="https://www.canal-u.tv/video/inria/embed.1/4_3_quantifier_la_similarite_de_deux_sequences.24696?width=100%&amp;height=100%" style="position:absolute;top:0;left:0;width:100%;height: 100%;" width="550" height="306" frameborder="0" allowfullscreen scrolling="no"></iframe></div> Si vous souhaitez partager une séquence, indiquez le début de celle-ci , et copiez le code : h m s Sandale Jb Cuir J Bleu Angie Ciel bradford rUrzwq4
Auteur(s) :
RECHENMANN Francois
Imperméable Jeans 60 Gj800901 Garcia Femme Manteau Noir UPqnaxHa

Producteur Canal-U :
2019 Cheville Zip Sexy Qualité Bottes Carré Véritable Haute TalonInria
Qualité Carré Véritable Sexy Bottes 2019 Haute Zip Talon Cheville

4.3. Quantifier la similarité de deux séquences

Le principe est donc de rechercher, dans les bases de données, des séquences similaires à celles que nous sommes en train d'étudier. Nous faisons aussi l'hypothèse que plus les séquences sont similaires, meilleure est la pertinence de l'information attachée à la séquence retrouvée dans la base de données.
Nous allons donc chercher un moyen de quantifier le niveau de similarité entre 2 séquences. Le premier moyen très simple, c'est d'utiliser la distance dite de Hamming. De quoi s'agit-il ? Très simple, en effet. Prenez ces 2 séquences ici. Vous pouvez très rapidement à l'oeil voir qu'elles diffèrent par 2 substitutions, 2 différences, ça va être la distance de Hamming. De même, cette paire ici, 3 substitutions, distance de Hamming, 3.
Est-ce une distance véritablement au sens mathématique du terme ? Je vous rappelle les 3 propriétés qu'une distance mathématique doit satisfaire : la distance d'une séquence à elle-même doit être nulle, ce qui est le cas, puisqu'il n'y a pas de différence entre les 2, pas de substitution ni quoi que ce soit, distance 0. La distance entre une séquence et une seconde séquence doit être la même qu'entre la seconde et la première. Bien entendu, le nombre de différences reste le même. Et la 3ème qui est dite l'inégalité qui doit être effectivement vérifiée elle aussi, ce que l'on peut faire assez facilement en prenant quelques exemples. C'est donc bien une distance au sens mathématique...

38 Dazely Yellow Femmes Eu Baskets Mellow Argenté R4SwpqOxx
 
 
RECHENMANN Francois
Smu Oxfork Cuir Chair Orange Kickers Femme Derbies Vernis pgYwvq14

Ingénieur et Docteur-Ingénieur en informatique, François Rechenmann est chercheur au centre Inria Grenoble – Rhône-Alpes. Il y exerce ses activités à l’interface de l’informatique et des sciences du vivant en contribuant plus particulièrement au développement de méthodes et de logiciels pour l’analyse des séquences génomiques des microorganismes. Cofondateur de la société Genostar, qui propose des solutions bioinformatiques aux industries pharmaceutiques, agroalimentaires et biotechnologiques, il en est le conseiller scientifique. Très impliqué dans les actions de médiation scientifique, François Rechenmann est le responsable scientifique du site Interstices dont l’objectif est d’expliquer l’informatique en tant que domaine de recherche.40 Wear Glitter Love I'd Cowboy Shop Miu Shoes Boots To C5RqRO


 
PARMENTELAT Thierry

Thierry Parmentelat a mené une carrière hybride entre les mondes académique et industriel. Ses centres d'intérêt couvrent les langages de programmation, les réseaux, et l'algèbre. Actuellement ingénieur de recherche chez Inria, Thierry Parmentelat utilise Python depuis plus de 10 ans pour ses travaux de recherche, ainsi que pour le développement des plateformes expérimentales dont il a la charge.


orange Nathanael 175323 Chaussures Marvin Lacets Chez amp;co Sarenza À F4zPxnP

commentaires


Ajouter un commentaire Lire les commentaires
*Les champs suivis d’un astérisque sont obligatoires.
Aucun commentaire sur cette vidéo pour le moment (les commentaires font l’objet d’une modération)
Sexy Véritable Carré Haute Cheville Bottes Talon Qualité Zip 2019
 

Dans la même collection

For Frank In Men Brown Wright Lyst Boots Hopper Mid wgxqpg4n
 
Chukka 42 medium Gwilawen Brown26 Homme Aldo 5 Bottes Marron 4qEwAW1v